La région Bourgogne est éligible, pour la période 2007/2013, entièrement ou pour partie de son territoire, à d’autres programmes cofinancés par le FEDER.
Par rapport au Programme opérationnel FEDER Bourgogne, ces programmes ont la particularité de cofinancer des dossiers qui dépassent le territoire de la Bourgogne en favorisant des partenariats entre régions françaises et européennes. Cependant, comme pour le Programme opérationnel bourguignon, ils conservent et soutiennent les mêmes priorités du FEDER liées à la Stratégie de Lisbonne, c’est-à-dire principalement l’innovation, la société de la connaissance et l’environnement.
Ces autres programmes sont :
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